Был студентом сценариста Нельсона Гиддинга в Университете Южной Калифорнии, после часто приходил гостем на его лекции. В 1988 году написал и в 1989 продал свой первый сценарий к фильму Ордер на смерть (1990). На полученные деньги купил автомобиль Isuzu Trooper, который был украден в первую же ночь.

Гойер написал несколько сценариев для различных комикс-миров, таких как Доктор Стрэндж, Призрачный гонщик, Бэтмен: Начало, Тёмный рыцарь и Флэш.

На пару с Джеймсом Робинсоном участвовал в перезапуске комикс-вселенной Justice Society of America в 1999 году.

Осенью 2009 года на канале ABC дебютировал сериал Вспомни, что будет, над которым он работает вместе Брэнноном Брагой. Сериал основан на романе Роберта Сойера под названием Flashforward.